MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Exiguobacterium sp. AT1b chromosome

Total Repeats: 54657

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012673	GGA	2	6	193	198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229915735
2	NC_012673	CAT	2	6	322	327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229915735
3	NC_012673	ATC	2	6	390	395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229915735
4	NC_012673	TCGAA	2	10	460	469	40 %	20 %	20 %	20 %	229915735
5	NC_012673	ATC	2	6	470	475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229915735
6	NC_012673	AGG	2	6	477	482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229915735
7	NC_012673	CA	3	6	518	523	50 %	0 %	0 %	50 %	229915736
8	NC_012673	TCA	2	6	524	529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229915736
9	NC_012673	GCA	2	6	568	573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229915736
10	NC_012673	TCG	2	6	584	589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229915736
11	NC_012673	AAG	2	6	599	604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229915736
12	NC_012673	CTT	2	6	673	678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229915736
13	NC_012673	ACA	2	6	710	715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229915736
14	NC_012673	CGA	2	6	890	895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229915736
15	NC_012673	GCAAA	2	10	970	979	60 %	0 %	20 %	20 %	229915737
16	NC_012673	CGT	2	6	985	990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229915737
17	NC_012673	G	6	6	995	1000	0 %	0 %	100 %	0 %	229915737
18	NC_012673	TCA	2	6	1061	1066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229915737
19	NC_012673	GAG	3	9	1076	1084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229915737
20	NC_012673	CCGA	2	8	1094	1101	25 %	0 %	25 %	50 %	229915737
21	NC_012673	ACGA	2	8	1143	1150	50 %	0 %	25 %	25 %	229915737
22	NC_012673	CCGA	2	8	1179	1186	25 %	0 %	25 %	50 %	229915737
23	NC_012673	TTGA	2	8	1201	1208	25 %	50 %	25 %	0 %	229915737
24	NC_012673	GA	3	6	1325	1330	50 %	0 %	50 %	0 %	229915737
25	NC_012673	CGA	2	6	1409	1414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229915737
26	NC_012673	CATTCG	2	12	1469	1480	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	229915738
27	NC_012673	GCC	2	6	1503	1508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229915738
28	NC_012673	AAAGC	2	10	1548	1557	60 %	0 %	20 %	20 %	229915738
29	NC_012673	C	6	6	1583	1588	0 %	0 %	0 %	100 %	229915738
30	NC_012673	GGC	2	6	1674	1679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229915738
31	NC_012673	GAA	2	6	1688	1693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229915738
32	NC_012673	AAC	2	6	1743	1748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229915738
33	NC_012673	CAG	2	6	1822	1827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229915738
34	NC_012673	CAT	2	6	1841	1846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229915738
35	NC_012673	GGC	2	6	1877	1882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229915738
36	NC_012673	CGAC	2	8	1900	1907	25 %	0 %	25 %	50 %	229915738
37	NC_012673	GTC	2	6	2082	2087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229915738
38	NC_012673	CGA	2	6	2090	2095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229915738
39	NC_012673	CAC	2	6	2100	2105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229915738
40	NC_012673	CGG	2	6	2110	2115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229915738
41	NC_012673	TCG	2	6	2122	2127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229915738
42	NC_012673	GGAC	2	8	2189	2196	25 %	0 %	50 %	25 %	229915738
43	NC_012673	GAAAT	2	10	2335	2344	60 %	20 %	20 %	0 %	229915738
44	NC_012673	AGGC	2	8	2356	2363	25 %	0 %	50 %	25 %	229915738
45	NC_012673	TCC	2	6	2389	2394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229915738
46	NC_012673	TCG	2	6	2428	2433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229915738
47	NC_012673	ATC	2	6	2628	2633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229915738
48	NC_012673	GAG	2	6	2634	2639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229915738
49	NC_012673	GAA	2	6	2858	2863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229915738
50	NC_012673	CGA	2	6	2917	2922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229915738
51	NC_012673	CAG	2	6	2982	2987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229915738
52	NC_012673	ACA	2	6	2989	2994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229915738
53	NC_012673	CACG	2	8	3043	3050	25 %	0 %	25 %	50 %	229915738
54	NC_012673	AAAACG	2	12	3215	3226	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	229915739
55	NC_012673	AGT	2	6	3234	3239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229915739
56	NC_012673	A	7	7	3242	3248	100 %	0 %	0 %	0 %	229915739
57	NC_012673	GTC	2	6	3310	3315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229915739
58	NC_012673	GAA	2	6	3349	3354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229915739
59	NC_012673	TCG	2	6	3368	3373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229915739
60	NC_012673	CGT	3	9	3492	3500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229915739
61	NC_012673	GAA	2	6	3550	3555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229915739
62	NC_012673	CGGACC	2	12	3572	3583	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	229915739
63	NC_012673	GCG	2	6	3634	3639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229915739
64	NC_012673	GAA	2	6	3652	3657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229915739
65	NC_012673	CGT	2	6	3684	3689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229915739
66	NC_012673	CAGA	2	8	3748	3755	50 %	0 %	25 %	25 %	229915739
67	NC_012673	GTC	2	6	3844	3849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229915739
68	NC_012673	GAC	2	6	3858	3863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229915739
69	NC_012673	CGAA	2	8	3953	3960	50 %	0 %	25 %	25 %	229915739
70	NC_012673	A	6	6	4017	4022	100 %	0 %	0 %	0 %	229915740
71	NC_012673	CAC	2	6	4159	4164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229915740
72	NC_012673	AAG	2	6	4193	4198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229915740
73	NC_012673	GTT	2	6	4207	4212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229915740
74	NC_012673	AGA	2	6	4300	4305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229915740
75	NC_012673	AG	3	6	4318	4323	50 %	0 %	50 %	0 %	229915740
76	NC_012673	TCG	2	6	4476	4481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229915740
77	NC_012673	CCA	2	6	4522	4527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229915740
78	NC_012673	A	6	6	4527	4532	100 %	0 %	0 %	0 %	229915740
79	NC_012673	CGA	2	6	4624	4629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229915740
80	NC_012673	AGC	2	6	4723	4728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229915740
81	NC_012673	GAA	3	9	4738	4746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229915740
82	NC_012673	GAA	2	6	4822	4827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229915740
83	NC_012673	AC	3	6	4980	4985	50 %	0 %	0 %	50 %	229915740
84	NC_012673	CGT	2	6	4990	4995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229915740
85	NC_012673	GAA	2	6	5128	5133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229915740
86	NC_012673	AGA	2	6	5146	5151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229915740
87	NC_012673	CTG	2	6	5162	5167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229915740
88	NC_012673	TGG	2	6	5226	5231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229915740
89	NC_012673	GAA	2	6	5236	5241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229915740
90	NC_012673	AAG	2	6	5303	5308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229915740
91	NC_012673	GAC	2	6	5402	5407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229915740
92	NC_012673	GTC	2	6	5471	5476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229915740
93	NC_012673	CGA	2	6	5491	5496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229915740
94	NC_012673	GAC	2	6	5522	5527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229915740
95	NC_012673	GAA	2	6	5656	5661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229915740
96	NC_012673	AGG	2	6	5664	5669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229915740
97	NC_012673	CGT	2	6	5707	5712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229915740
98	NC_012673	GGA	2	6	5731	5736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229915740
99	NC_012673	ACA	2	6	5829	5834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229915740
100	NC_012673	TCG	2	6	5844	5849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229915740
101	NC_012673	GAC	2	6	5855	5860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229915740
102	NC_012673	CTG	2	6	5864	5869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229915740
103	NC_012673	TCG	2	6	5955	5960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229915740
104	NC_012673	CAT	2	6	5998	6003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229915740
105	NC_012673	GCGA	2	8	6021	6028	25 %	0 %	50 %	25 %	229915740
106	NC_012673	CGA	2	6	6042	6047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229915740
107	NC_012673	GAC	2	6	6176	6181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229915740
108	NC_012673	GAAA	2	8	6334	6341	75 %	0 %	25 %	0 %	229915740
109	NC_012673	CAA	2	6	6346	6351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229915740
110	NC_012673	TCGAT	2	10	6364	6373	20 %	40 %	20 %	20 %	229915740
111	NC_012673	ACG	2	6	6396	6401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229915740
112	NC_012673	GAA	2	6	6407	6412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229915740
113	NC_012673	CGT	2	6	6441	6446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229915740
114	NC_012673	GAA	2	6	6466	6471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229915740
115	NC_012673	GACGA	2	10	6521	6530	40 %	0 %	40 %	20 %	229915740
116	NC_012673	CGAC	2	8	6582	6589	25 %	0 %	25 %	50 %	229915740
117	NC_012673	TCG	2	6	6690	6695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229915740
118	NC_012673	TAC	2	6	6770	6775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229915740
119	NC_012673	GAA	2	6	6841	6846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229915740
120	NC_012673	TCA	2	6	6885	6890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229915740
121	NC_012673	CAG	2	6	6902	6907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229915740
122	NC_012673	GGT	2	6	7016	7021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229915740
123	NC_012673	ACA	2	6	7083	7088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229915740
124	NC_012673	CGA	3	9	7090	7098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229915740
125	NC_012673	ACT	2	6	7104	7109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229915740
126	NC_012673	AAG	2	6	7110	7115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229915740
127	NC_012673	GCCGA	2	10	7276	7285	20 %	0 %	40 %	40 %	229915741
128	NC_012673	ATC	2	6	7321	7326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229915741
129	NC_012673	CCA	2	6	7543	7548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229915741
130	NC_012673	CGT	2	6	7557	7562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229915741
131	NC_012673	AT	3	6	7608	7613	50 %	50 %	0 %	0 %	229915741
132	NC_012673	TCA	2	6	7667	7672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229915741
133	NC_012673	TTA	2	6	7697	7702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229915741
134	NC_012673	ATCG	2	8	7709	7716	25 %	25 %	25 %	25 %	229915741
135	NC_012673	GAT	2	6	7800	7805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229915741
136	NC_012673	CAA	2	6	7937	7942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229915742
137	NC_012673	AACCC	2	10	8010	8019	40 %	0 %	0 %	60 %	229915742
138	NC_012673	AAG	2	6	8026	8031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229915742
139	NC_012673	GAA	2	6	8131	8136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229915742
140	NC_012673	CGA	2	6	8211	8216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229915742
141	NC_012673	GGAG	2	8	8274	8281	25 %	0 %	75 %	0 %	229915742
142	NC_012673	CCA	2	6	8312	8317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229915742
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144	NC_012673	GAAAA	2	10	8404	8413	80 %	0 %	20 %	0 %	229915742
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146	NC_012673	G	6	6	8554	8559	0 %	0 %	100 %	0 %	229915743
147	NC_012673	CCA	2	6	8593	8598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229915743
148	NC_012673	GGA	2	6	8676	8681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229915743
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150	NC_012673	CGAG	2	8	8747	8754	25 %	0 %	50 %	25 %	229915743
151	NC_012673	TAC	2	6	8767	8772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229915743
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153	NC_012673	TCC	2	6	8825	8830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229915743
154	NC_012673	GACA	2	8	8859	8866	50 %	0 %	25 %	25 %	229915743
155	NC_012673	AAG	2	6	8905	8910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229915743
156	NC_012673	GAA	2	6	8929	8934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229915743
157	NC_012673	TATC	2	8	8984	8991	25 %	50 %	0 %	25 %	229915743
158	NC_012673	CGT	2	6	9015	9020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229915743
159	NC_012673	CACG	2	8	9117	9124	25 %	0 %	25 %	50 %	229915743
160	NC_012673	TGA	2	6	9218	9223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229915743
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163	NC_012673	AAG	2	6	9404	9409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229915743
164	NC_012673	ACT	2	6	9458	9463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229915743
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167	NC_012673	CAT	2	6	9645	9650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229915743
168	NC_012673	CAA	2	6	9723	9728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229915743
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245	NC_012673	A	6	6	13747	13752	100 %	0 %	0 %	0 %	229915749
246	NC_012673	CAA	2	6	13764	13769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229915749
247	NC_012673	TGAA	2	8	13844	13851	50 %	25 %	25 %	0 %	229915750
248	NC_012673	GGC	2	6	13902	13907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229915750
249	NC_012673	CGT	2	6	13916	13921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229915750
250	NC_012673	AGA	2	6	14004	14009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229915750
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252	NC_012673	TCG	2	6	14172	14177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229915750
253	NC_012673	AGTA	2	8	14198	14205	50 %	25 %	25 %	0 %	229915750
254	NC_012673	CGAC	2	8	14319	14326	25 %	0 %	25 %	50 %	229915751
255	NC_012673	GTA	2	6	14327	14332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229915751
256	NC_012673	ATA	2	6	14394	14399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229915751
257	NC_012673	TTCGAT	2	12	14567	14578	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	229915752
258	NC_012673	AAAC	2	8	14659	14666	75 %	0 %	0 %	25 %	229915752
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260	NC_012673	CAG	2	6	14833	14838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229915753
261	NC_012673	GAC	2	6	14844	14849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229915753
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386	NC_012673	CAT	2	6	22057	22062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229915762
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